Gereja Allah Baik House of Prayer Sidoarjo melakukan baptisan air seperti yang ditetapkan oleh Tuhan Yesus (Matius 28:19-20 & Markus 16:15,16).
Makna dari baptisan sendiri yaitu: Baptisan adalah tanda (kepada) pertobatan (Matius 3:11), Tanda ketataan kepada perintah Tuhan (bahwa seseorang telah lahir baru atau telah diselamatkan (Matius 28:18-19)), Baptisan air adalah kesaksian bahwa orang tersebut telah dimeteraikan dan menerima hidup baru dan mengambil bagian dalam kematian dan kebangkitan Kristus (Roma 6:3-6).